Kjemisk desinfeksjon brukes som et supplement til rengjøring og utføres i hovedsak på tre ulike måter.

1. Flekkdesinfeksjon

   Flekkdesinfeksjon benyttes ved synlig søl av større mengder infeksiøst materiale, slik som sekreter, ekskreter, oppkast, avføring o.l. Sølet dekkes da med absorberende materiale som fuktes med desinfeksjonsmidlet, og som får virke i angitt virketid. Området må holdes fuktig i hele virketiden, og ev. må det derfor påføres nytt desinfeksjonsmiddel underveis. Etter avsluttet desinfeksjon foretas rengjøring. Avhengig av hva som er praktisk mulig, kan også sølet fjernes manuelt med absorberende materiale fuktet med desinfeksjonsmiddel før nytt desinfeksjonsmiddel påføres. Nødvendig personlig beskyttelsesutstyr må brukes (hansker, ev. munnbind, briller og vernetøy).

2. Desinfeksjon av kontaktpunkter

   Felles kontaktpunkter/berøringspunkter, slik som håndtak, brytere, kraner, toalettseter, tastaturer, sengegavler o.l. vil ofte være kontaminert med mikrober fra pasienter og personale. Ved isolering og utbruddsituasjoner kan det være hensiktsmessig å desinfisere slike kontaktpunkter regelmessig, f.eks. ved hvert vaktskifte, ev. hyppigere.

3. Generell desinfeksjon av inventar og flater

   Ved opphør av isolering vil det rutinemessig bli utført desinfeksjon av flater og inventar før rengjøring. Omfanget av desinfeksjon vil være avhengig av hvilken isoleringsform som har vært benyttet (kontakt-, dråpe- eller luftsmitteisolering).

   Automatiske desinfeksjonsmetoder (hydrogenperoksidgass eller ultafiolett lys [UVC]) kan noen ganger være et alternativ til manuell desinfeksjon, både for å øke sikkerheten og for å redusere arbeidsbelastning og kjemikalieeksponering av personalet.